Agarose gel é facilmente derramado para o uso e as amostras podem ser facilmente recuperados . O gel também é altamente modificado para aumentar a distância entre as moléculas de DNA grandes e pequenos . Uma vez que é feita a partir de um açúcar presente nas algas , agarose é mais barato do que as alternativas e um produto mais seguro para uso em gel de electroforese .
Acrilamida gel
como agarose , acrilamida é fácil de modificar . Com uma capacidade de carga mais elevada , é possível executar várias amostras ao mesmo . É principal vantagem sobre agarose é que a acrilamida tem poros menores , tornando -o mais adequado para a separação de moléculas de ADN mais pequenas que em gel de agarose não seria capaz de separar . No entanto, borbulhante é um problema maior para a acrilamida, e , uma vez que a acrilamida é uma neurotoxina , pode ser muito perigoso para se trabalhar.
Eletroforese Capilar
porque o calor se dissipa rapidamente no polímero , electroforese capilar leva menos tempo do que o gel; minutos em comparação com horas . Além disso, uma vez que os resultados são monitorizados electronicamente todo o processo pode ser automatizado . No entanto , a electroforese capilar não pode ser executado como muitas amostras simultaneamente , como géis , e as máquinas ( preço de mais de $ 100.000 , por unidade ) e reagentes de custo substancialmente mais do que o método do gel de separação , de modo que a maioria dos laboratórios não têm acesso ao tecnologia.